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同学们好,我是金博教育的生物老师。今天咱们来聊聊基因工程里那些特别重要的工具酶,这个专题在高考中可是高频考点,很多同学学起来觉得抽象,总搞混不同酶的功能。别担心,今天我用最直白的方式把这些酶讲清楚,保证你听完有种"原来如此"的感觉。
在讲具体的酶之前,我想先问大家一个问题:如果让你把两段DNA拼在一起,然后插入到细菌的DNA里,让细菌帮你生产胰岛素,你能想到什么办法?
是不是觉得无从下手?DNA那么小,肉眼都看不见,更别说精准切割和拼接了。但科学家们很聪明,他们在自然界找到了一些"天然工具",这些工具就是基因工程的工具酶。它们就像分子世界里的手术刀、针线,能对DNA进行精确的切割、连接和修饰。
这些酶大多来自微生物。微生物在进化过程中发展出了这些功能,用来抵抗外源DNA的入侵,或者完成自身的DNA代谢。科学家们发现这些功能后,就把这些微生物的"武器"借过来,为人类所用。接下来我们就一个一个认识这些重要的工具酶。
限制性核酸内切酶,通常我们直接叫它限制酶,这是基因工程中最核心的工具之一。你知道吗,限制酶的发现还拿过诺贝尔奖呢!1978年,瑞士的阿尔伯、美国的史密斯和内森斯因为发现限制酶而共同获得了诺贝尔生理学或医学奖,可见这个酶有多重要。

限制酶存在于细菌中,是细菌抵御病毒(噬菌体)入侵的防御系统的一部分。当噬菌体的DNA进入细菌后,细菌会产生限制酶,把外来的噬菌体DNA切成一段一段的,这样就能阻止病毒在细菌体内繁殖。细菌自己的DNA上会有一些特殊的修饰,比如甲基化,这样限制酶就不会切割自己的DNA了。
限制酶有很多种,但高考重点考查的主要是Ⅱ型限制酶。Ⅰ型和Ⅲ型限制酶虽然也存在,但它们切割位点不在识别序列上或者切割位点距离识别序列太远,在基因工程中不太好用,所以我们主要学习Ⅱ型。
Ⅱ型限制酶有几个非常重要的特点,这些特点也是高考的常考点。第一,它识别的是特定的核苷酸序列,通常是4到8个碱基对,而且这些序列具有回文结构。什么叫回文结构?就是你从5'到3'读和从3'到5'读,序列是一样的。比如最常见的EcoRⅠ,它识别的序列是GAATTC,从左往右读是G-A-A-T-T-C,从右往左读同样是G-A-A-T-T-C,完全对称。
第二,Ⅱ型限制酶在识别序列内部进行切割,而且切割的结果是产生粘性末端或者平末端。粘性末端就是切割后DNA两端留下几个碱基的单链部分,这样的末端很容易和其他互补的末端配对。平末端就是直接切断,不留下单链部分。
这里有个重点需要大家记住:不同的限制酶即使识别不同的序列,只要它们能产生相同的粘性末端,原则上就可以互相连接。比如BamHⅠ识别的序列是GGATCC,切割后产生GATC的粘性末端;BglⅡ识别的序列是AGATCT,切割后也产生GATC的粘性末端。这两个酶切割后产生的末端可以互相连接,但连接后的序列就不能被原来的酶识别了。
课本上经常提到的限制酶有EcoRⅠ、HindⅢ、BamHⅠ等。EcoRⅠ来自大肠杆菌,它切割GAATTC序列,产生粘性末端。HindⅢ来自流感嗜血杆菌,识别序列是AAGCTT,同样产生粘性末端。BamHⅠ识别GGATCC序列。
考试中经常会让同学们判断酶切后的结果,或者给出几个酶的识别序列,让你分析能不能切割出相同的末端。这部分内容需要大家多练,熟能生巧。

切开DNA只是第一步,我们还需要把不同的DNA片段连接起来,这个任务就交给DNA连接酶。
DNA连接酶的作用是催化DNA片段之间形成磷酸二酯键。大家知道,DNA的基本骨架就是由磷酸二酯键把一个一个核苷酸连接起来的。限制酶切开了DNA,在末端留下了缺口,连接酶就是负责把这个缺口缝上的。
这里有个关键点需要强调:DNA连接酶只能连接DNA片段之间的缺口,不能随便把两个DNA分子连在一起。它需要两个DNA片段的末端是互补的或者匹配的才能连接。
高考常考的是两种连接酶:一种是从大肠杆菌中提取的大肠杆菌DNA连接酶,另一种是从T4噬菌体中提取的T4 DNA连接酶。这两种酶有区别:大肠杆菌DNA连接酶只能连接粘性末端,而T4 DNA连接酶既能连接粘性末端,也能连接平末端,只是连接平末端的效率低一些。
很多同学会把DNA连接酶和DNA聚合酶搞混,这两个是完全不同的酶。DNA聚合酶是在DNA复制的时候用的,它需要模板,需要引物,作用是把脱氧核苷酸一个一个加到DNA链上。而DNA连接酶不关心序列,它只负责把已经存在的两个DNA片段连在一起。
简单记忆:聚合酶是"添砖加瓦",连接酶是"缝缝补补"。
DNA聚合酶在基因工程中主要用于DNA的PCR扩增和DNA的修补。PCR技术中使用的Taq酶就是一种DNA聚合酶,它来自水生栖热菌,能在高温下保持活性。
DNA聚合酶有一个重要的特点:它只能从5'向3'方向合成DNA,不能反向合成。而且它需要一条已经存在的DNA链作为引物才能开始合成。这两个特点是理解PCR原理的关键。
逆转录酶,也叫反转录酶,这个酶很特别,它是以RNA为模板来合成DNA的。在正常的中心法则中,遗传信息是从DNA流向RNA的,但逆转录酶打破了这一点,实现了从RNA到DNA的逆转录。
这个酶来自逆转录病毒,比如艾滋病病毒(HIV)就是逆转录病毒。基因工程中,逆转录酶主要用于构建cDNA文库。我们可以从细胞的mRNA出发,用逆转录酶合成互补的DNA(cDNA),这个cDNA可以被克隆到载体里,在细菌中表达。
为什么逆转录酶这么重要?因为真核生物的基因是断裂基因,包含外显子和内含子,而原核生物没有内含子。如果我们直接用基因组DNA在原核生物中表达,内含子会被当成"垃圾"处理掉,蛋白质就无法正确合成。但如果用mRNA逆转录得到的cDNA,它已经去掉了内含子,就可以在原核生物中正常表达了。
末端转移酶是用来给DNA片段加上poly(A)尾巴的。这个酶来自小牛胸腺,它能催化脱氧腺苷酸(dATP)加到DNA的3'末端。高考中对这个酶的考查不多,但了解一下有助于理解cDNA文库的构建过程。
碱性磷酸酶的作用是去除DNA片段5'末端的磷酸基团。这个酶在基因工程中有一个重要用途:防止载体自连。
想象一下,如果你用限制酶切开了载体,载体两端都有磷酸基团。如果我们不用碱性磷酸酶处理,直接用DNA连接酶连接,载体可能两端自己连起来,形成没有插入外源DNA的空载体。但如果用碱性磷酸酶去掉5'末端的磷酸基团,载体就无法自连了,因为DNA连接酶需要两边的磷酸基团才能形成磷酸二酯键。这时候,只有当外源DNA片段插入进来,两端各提供一个磷酸基团,连接才能成功。这样就大大提高了阳性克隆的比例。
讲到这里,大家应该发现了,基因工程不是一个酶能完成的工作,需要多种酶协同配合。让我用一个具体的例子来说明。
假设我们要克隆一个基因到质粒载体里,步骤大概是这样的:首先用限制酶切割目的基因,同时用相同的限制酶切割质粒载体,使它们产生互补的粘性末端;然后用碱性磷酸酶处理质粒载体,防止载体自连;接下来把目的基因和载体混合,加入DNA连接酶,让它们连接起来;然后把这个重组DNA导入到细菌里;最后,细菌里的DNA聚合酶会帮助修复和复制这个重组DNA。
如果是从mRNA出发构建cDNA,还需要用到逆转录酶先用mRNA合成cDNA第一条链,然后再用DNA聚合酶合成第二条链。
通过对历年高考题的分析,我发现基因工程工具酶的考查有几个明显的特点。
首先是考查细节。比如限制酶的识别序列特点、回文结构的判断、切割后末端的类型等。这些内容需要精准记忆,容不得半点马虎。考试中经常给出几个酶的识别序列,让你判断哪些能产生相同的末端,或者切割后能不能连接。
其次是考查原理。比如为什么限制酶能特异性切割DNA?限制酶为什么不会切割细菌自己的DNA?这些原理性的问题需要理解,不能死记硬背。
第三是综合应用。很多题目会把几种工具酶放在一起考,让你判断某一步应该用什么酶,或者解释某个步骤的原理。这就需要对每种酶的功能都烂熟于心。
解题技巧方面,我建议大家画图辅助理解。基因工程的题目很多时候涉及到DNA片段的切割和连接,画出示意图能帮助理清思路。比如拿到一道限制酶切割的题目,先在纸上画出原始的DNA序列,标出限制酶的识别位置,然后模拟切割过程,最后看产物的末端类型。
在学习这部分内容时,我发现同学们有几个容易犯的错误。
第一是把限制酶和DNA酶搞混。限制酶是切割DNA的,但它有特异性,只切割特定的序列。而普通的DNA酶没有特异性,会随机切割DNA。
第二是混淆粘性末端和平末端。粘性末端是交错切割产生的,有单链突出;平末端是平齐切割产生的,没有单链突出。粘性末端更容易连接,因为碱基可以互补配对。
第三是不理解"同尾酶"的概念。同尾酶是指切割后产生相同粘性末端的一类限制酶。比如BamHⅠ和BglⅡ都能产生GATC末端,它们就是同尾酶。同尾酶切割后的末端可以互相连接,但连接后的序列不能再被原来的酶切割了。
第四是忘记限制酶的来源。限制酶的命名有规则:第一个字母来自生物属名的第一个字母(大写),第二、三个字母来自种名的前两个字母(小写),第四个字母(如果有)表示菌株,最后的数字表示在这个菌株中发现的第几种限制酶。比如EcoRⅠ,E是Escherichia(大肠杆菌属),co是coli(种名),R是菌株,Ⅰ表示第一种。
最后,给大家一些学习这部分内容的建议。工具酶的名称、功能、特点这些内容确实比较多,但只要掌握了规律,学起来并不难。
建议大家用表格的形式把这些酶整理对比一下,这样一目了然,容易记忆。然后多做练习题,特别是综合性的题目,通过做题来检验自己是否真正理解了。
另外,这部分内容和生活联系也很紧密。比如胰岛素的生产、干扰素的制备、转基因食品的检测,都用到基因工程的技术。如果你能把所学知识和社会热点联系起来,学习起来会更有兴趣,也更容易理解。
好啦,关于基因工程工具酶的内容就讲到这里。希望同学们都能把这部分内容吃透,在高考中取得好成绩。学习上有什么问题,随时来金博教育找我讨论。

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